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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
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Data corrente: |
29/11/2017 |
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Data da última atualização: |
06/05/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NICKEL, O.; SILVA, F. N; FAJARDO, T. V. M.; GORAYEB, E. S. |
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Afiliação: |
OSMAR NICKEL, CNPUV; Fabio N. Silva, Programa de Pós-graduação em Produção Vegetal, Centro de Ciências Agroveterinárias, Universidade do Estado de Santa Catarina, Lages, SC 88520-000, Brazil; THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; Eduardo E. Gorayeb, Programa de Pós-graduação em Produção Vegetal, Centro de Ciências Agroveterinárias, Universidade do Estado de Santa Catarina, Lages, SC 88520-000, Brazil. |
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Título: |
Characterization and genetic variability of coat protein genes of Apple chlorotic leaf spot virus isolates from southern Brazil. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, v. 43, n. 2, p.109-116, 2018. |
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Páginas: |
8 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s40858-017-0197-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
https://doi.org/10.1007/s40858-017-0197-6 |
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Conteúdo: |
Apple chlorotic leaf spot virus(ACLSV) infects temperate rosaceous fruit trees worldwide and causes a wide range of diseases that are economically highly damaging. This study was carried out to analyze genetic variability of regional ACLSV isolates and compare it with ACLSV isolates from other parts of the world. Nineteen amplicons of ACLSV, corresponding to the coat protein (CP) gene of isolates from apple, plum, and nectarine, from two states in southern Brazil, have been analyzed for genetic variation and compared phylogenetically among themselves and with other sequences available in GenBank. Sequences identities among complete CP genes of these isolates ranged from 87.5 to 100% and 92.2 to 100% at the nucleotide (nt) and the deduced amino acid (daa) levels, respectively. In the comparison with isolates from Asia, Europe and North America, identities were 68.4 to 100% and 72.5 to 100% at nt and daa levels, respectively. Phylogenetic trees based on nucleotide sequences showed that these isolates grouped into two clusters, cluster 1 containing apple isolates and cluster 2 comprising apple, plum and nec- tarine isolates. Most Brazilian isolates showed conserved signatures (Ser 40 ,Leu 59 ,Tyr 75 ,Thr 130 and Leu 184 )intheirCPs, which place them with type B6 isolates. However, some Brazilian isolates were found to be variants of type B6. These analyzes indicated that Brazilian isolates had lower genetic variability compared to isolates from China, India and Japan and that the CP genes were under negative selection. The greatest diversity of nucleotides was observed in the central portion of the CP gene, represented predominantly by synonymous substitutions. One natural recombinant was detected among ACLSV isolates from Brazil. Keywords ACLSV . Molecular characterization. Variability. Phylogeny. Recombination. Selection. MenosApple chlorotic leaf spot virus(ACLSV) infects temperate rosaceous fruit trees worldwide and causes a wide range of diseases that are economically highly damaging. This study was carried out to analyze genetic variability of regional ACLSV isolates and compare it with ACLSV isolates from other parts of the world. Nineteen amplicons of ACLSV, corresponding to the coat protein (CP) gene of isolates from apple, plum, and nectarine, from two states in southern Brazil, have been analyzed for genetic variation and compared phylogenetically among themselves and with other sequences available in GenBank. Sequences identities among complete CP genes of these isolates ranged from 87.5 to 100% and 92.2 to 100% at the nucleotide (nt) and the deduced amino acid (daa) levels, respectively. In the comparison with isolates from Asia, Europe and North America, identities were 68.4 to 100% and 72.5 to 100% at nt and daa levels, respectively. Phylogenetic trees based on nucleotide sequences showed that these isolates grouped into two clusters, cluster 1 containing apple isolates and cluster 2 comprising apple, plum and nec- tarine isolates. Most Brazilian isolates showed conserved signatures (Ser 40 ,Leu 59 ,Tyr 75 ,Thr 130 and Leu 184 )intheirCPs, which place them with type B6 isolates. However, some Brazilian isolates were found to be variants of type B6. These analyzes indicated that Brazilian isolates had lower genetic variability compared to isolates from China, India and Japan and that t... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
ACLSV (Apple chlorotic leaf spot virus); Apple; Molecular characterization; Recombination; Selection; Temperate rosaceous fruit trees. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic recombination; Phylogeny; Variability. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/190140/1/Nickel2018-Article-CharacterizationAndGeneticVari.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
19/01/2015 |
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Data da última atualização: |
19/01/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
AVILA, P. C.; JUNQUEIRA, A. da C.; GONCALVES, J. R. P.; MORICONI, W.; CANUTO, J. C. |
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Afiliação: |
PATRICIA CAMPARO AVILA, FCA-UNESP; ALEXANDRE DA COSTA JUNQUEIRA; JOSE RICARDO PUPO GONCALVES, CNPMA; WALDEMORE MORICONI, CNPMA; JOAO CARLOS CANUTO, CNPMA. |
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Título: |
Avaliação da resistência à penetração em diferentes sistemas em lote de reforma agrária no município de Itapeva, SP. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA DE ESTUDOS EM ASSENTAMENTOS RURAIS, 6., 2013, Campinas. Caderno de Resumos... Campinas: Universidade Estadual de Campinas, 2013. |
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Páginas: |
6 p. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O sistema vivo, complexo e dinâmico do solo tem sido, no ultimo século, considerado apenas um suporte inerte para a obtenção de lucro pela agricultura convencional e os passivos de degradação de sua estrutura física, química e biológica já são entraves à melhoria de qualidade de vida dos agricultores, dentro da realidade de escassez de recursos e assistência técnica dos assentamentos rurais do estado de São Paulo (PRIMAVESI, 2002; GLIESSMAN, 2009). Um dos legados do manejo inadequado com maquinaria pesada e cultivo intensivo, deixado nos solos da maioria das áreas destinadas à assentamentos rurais, é a compactação ou o chamado "pé-de-grande" (RAMOS FILHO e PELLEGRINI, 2006). A destruição da bioestrutura do solo compromete a estabilidade, resistência às intempéries, fornecimento de água e oxigênio para os cultivos e, portanto, constitui-se na principal causa dos problemas de produtividade na agricultura tropical (PRIMAVESI, 2002). Dentro deste contexto têm surgido nos últimos anos diversas iniciativas de alternativas de manejo agroecológico do solo na forma de sistemas agroflorestais (SAFs). Pelo fato de aliar no mesmo espaço e/ou tempo o cultivo de grande diversidade de espécies agrícolas anuais, florestais perenes, herbáceas, arbustivas e arbóreas, os SAFs imitam e se fundamentam na estrutura multiestratificada complexa e na dinâmica dos processos ecológicos de ecossistemas florestais naturais (PENEIREIRO et al., 2002). A camada de estratos acima do solo e a "capa" de folhas o protege dos impactos do sol, chuva e vento, evitando a destruição de sua estrutura, a sua erosão e compactação. A incorporação frequente de matéria orgânica reconstrói o solo e a camada ampla e complexa de raízes abaixo da superfície promove a descompactação, aeração e aumento da infiltração de água. Experiências de SAF com objetivo de aliar conservação do solo com produção agrícola vêm sendo construídas no assentamento Pirituba II, localizado no município de Itapeva, SP, cujo histórico anterior é de produção convencional de grãos com uso intensivo de maquinaria pesada em extensas áreas de monocultivo. O presente estudo foi realizado no lote dos agricultores João Pereira da Silva e Eva Conceição da Silva que tem trabalhado com agrofloresta desde 2006. Dentro deste contexto, o monitoramento do sistema por indicadores de sustentabilidade se constitui em uma ferramenta essencial de qualificação da experiência e de base para melhorias de práticas de manejo, indicando modificações em atributos-chave na dinâmica do agroecossistema (DEPONTI et al., 2002). Neste sentido o objetivo principal deste trabalho foi analisar os efeitos do uso e manejo agroecológico do solo na forma de SAF, através de medições com equipamento de medição de compactação, o penetrômetro. MenosO sistema vivo, complexo e dinâmico do solo tem sido, no ultimo século, considerado apenas um suporte inerte para a obtenção de lucro pela agricultura convencional e os passivos de degradação de sua estrutura física, química e biológica já são entraves à melhoria de qualidade de vida dos agricultores, dentro da realidade de escassez de recursos e assistência técnica dos assentamentos rurais do estado de São Paulo (PRIMAVESI, 2002; GLIESSMAN, 2009). Um dos legados do manejo inadequado com maquinaria pesada e cultivo intensivo, deixado nos solos da maioria das áreas destinadas à assentamentos rurais, é a compactação ou o chamado "pé-de-grande" (RAMOS FILHO e PELLEGRINI, 2006). A destruição da bioestrutura do solo compromete a estabilidade, resistência às intempéries, fornecimento de água e oxigênio para os cultivos e, portanto, constitui-se na principal causa dos problemas de produtividade na agricultura tropical (PRIMAVESI, 2002). Dentro deste contexto têm surgido nos últimos anos diversas iniciativas de alternativas de manejo agroecológico do solo na forma de sistemas agroflorestais (SAFs). Pelo fato de aliar no mesmo espaço e/ou tempo o cultivo de grande diversidade de espécies agrícolas anuais, florestais perenes, herbáceas, arbustivas e arbóreas, os SAFs imitam e se fundamentam na estrutura multiestratificada complexa e na dinâmica dos processos ecológicos de ecossistemas florestais naturais (PENEIREIRO et al., 2002). A camada de estratos acima do solo e a "capa" de folha... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Agroecologia; Penetrômetro; Sistema agroflorestal. |
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Thesagro: |
Agricultura orgânica; Agrossilvicultura; Recuperação do solo. |
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Thesaurus NAL: |
Agroecology; Agroforestry; Penetrometers; Soil amendments. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/115943/1/2014AA02.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: JORNADA DE ESTUDOS EM ASSENTAMENTOS RURAIS, 6., 2013, Campinas. Caderno de Resumos... Campinas: Universidade Estadual de Campinas$c2013
300 $a6 p.
520 $aO sistema vivo, complexo e dinâmico do solo tem sido, no ultimo século, considerado apenas um suporte inerte para a obtenção de lucro pela agricultura convencional e os passivos de degradação de sua estrutura física, química e biológica já são entraves à melhoria de qualidade de vida dos agricultores, dentro da realidade de escassez de recursos e assistência técnica dos assentamentos rurais do estado de São Paulo (PRIMAVESI, 2002; GLIESSMAN, 2009). Um dos legados do manejo inadequado com maquinaria pesada e cultivo intensivo, deixado nos solos da maioria das áreas destinadas à assentamentos rurais, é a compactação ou o chamado "pé-de-grande" (RAMOS FILHO e PELLEGRINI, 2006). A destruição da bioestrutura do solo compromete a estabilidade, resistência às intempéries, fornecimento de água e oxigênio para os cultivos e, portanto, constitui-se na principal causa dos problemas de produtividade na agricultura tropical (PRIMAVESI, 2002). Dentro deste contexto têm surgido nos últimos anos diversas iniciativas de alternativas de manejo agroecológico do solo na forma de sistemas agroflorestais (SAFs). Pelo fato de aliar no mesmo espaço e/ou tempo o cultivo de grande diversidade de espécies agrícolas anuais, florestais perenes, herbáceas, arbustivas e arbóreas, os SAFs imitam e se fundamentam na estrutura multiestratificada complexa e na dinâmica dos processos ecológicos de ecossistemas florestais naturais (PENEIREIRO et al., 2002). A camada de estratos acima do solo e a "capa" de folhas o protege dos impactos do sol, chuva e vento, evitando a destruição de sua estrutura, a sua erosão e compactação. A incorporação frequente de matéria orgânica reconstrói o solo e a camada ampla e complexa de raízes abaixo da superfície promove a descompactação, aeração e aumento da infiltração de água. Experiências de SAF com objetivo de aliar conservação do solo com produção agrícola vêm sendo construídas no assentamento Pirituba II, localizado no município de Itapeva, SP, cujo histórico anterior é de produção convencional de grãos com uso intensivo de maquinaria pesada em extensas áreas de monocultivo. O presente estudo foi realizado no lote dos agricultores João Pereira da Silva e Eva Conceição da Silva que tem trabalhado com agrofloresta desde 2006. Dentro deste contexto, o monitoramento do sistema por indicadores de sustentabilidade se constitui em uma ferramenta essencial de qualificação da experiência e de base para melhorias de práticas de manejo, indicando modificações em atributos-chave na dinâmica do agroecossistema (DEPONTI et al., 2002). Neste sentido o objetivo principal deste trabalho foi analisar os efeitos do uso e manejo agroecológico do solo na forma de SAF, através de medições com equipamento de medição de compactação, o penetrômetro.
650 $aAgroecology
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650 $aSoil amendments
650 $aAgricultura orgânica
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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